質譜儀停電保護的注意事項如下：
1、最好不用直接進樣(容易污染離子源)。
2、做聯用時最好分流(①可以使用常規柱，②縮短分析時間，③延長質量分析器壽命)。
3、最好使用在線切換閥，降前每個樣品的前后1-2分鐘的流動相切入廢液。
4、開始聯用前，直接運行質譜數分鐘，可以先將溫度。
5、待機時將切換閥置于waste，避免剛開液相時將流動相打入離子源。
6、關機前毛細管的溫度先降下來，穩定一段時間后再關閉電源，避免風扇停止轉動后毛細管外圍的熱量向里擴散，容易引起內部線路及電子元器件老化加速。
7、每天清理毛細管口外部，擦洗干凈，每次停機時注意清洗Skimmer，用無塵擦拭紙，kimberly那種。
8、如果用的是鋼瓶而且天天做樣的話，將兩個鋼瓶并聯，當然，一月不做一次的話就算了。
9、做定量時注意離子源噴針的具體位置，否則標準曲線就不能用了。
10、不要不經過柱子分離進行定量分析，結果不可靠(競爭性抑制目標分子離子化)。
11、如果是負離子檢測的話，可以相流動相中加入少量異丙醇。
12、不要使用不揮發性鹽，如果使用揮發性鹽，但濃度不要超過20mmol/l。
13、需要使用酸的情況下可以用甲酸，乙酸可以用，但能用甲酸或乙酸時就別用TFA。
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